đối với trường hợp này khoản a mục 5 điều 9 chương II thông tư 28/2011/tt-btc quy định "Sau khi hết hạn nộp hồ sơ khai thuế theo quy định, người nộp thuế phát hiện hồ sơ khai thuế đã nộp cho cơ quan thuế có sai sót, nhầm lẫn gây ảnh hưởng đến số thuế phải nộp thì được khai bổ sung hồ sơ khai thuế. Hồ sơ khai thuế bổ sung được nộp cho cơ quan thuế vào bất cứ ngày làm việc nào, không phụ thuộc vào thời hạn nộp hồ sơ khai thuế của lần tiếp theo, nhưng phải trước khi cơ quan thuế, cơ quan có thẩm quyền công bố quyết định kiểm tra thuế, thanh tra thuế tại trụ sở người nộp thuế." như vậy bạn hãy tham khảo trên thông tư này để xử lý. tất nhiên khi điều chỉnh hóa đơn bên mua hàng sẽ phải nộp số thuế chênh lệch cho đủ số thuế đã khấu trừ, đồng thời bị tính phạt chậm nộp 0.05%/ ngày theo quy định